scipy.cluster.hierarchy.optimal_leaf_ordering¶
- scipy.cluster.hierarchy.optimal_leaf_ordering(Z, y, metric='euclidean')[源代码]¶
在给定链接矩阵Z和距离的情况下，对切割的树重新排序。
- 参数
- Zndarray
该分层聚类被编码为链接矩阵。看见
linkage有关返回结构和算法的详细信息，请执行以下操作。- yndarray
生成Z的凝聚距离矩阵。或者，n维的m个观测向量的集合可以作为m×n阵列传递。
- metric字符串或函数，可选
在y是观测向量集合的情况下使用的距离度量；否则忽略。请参阅
pdist函数获取有效距离度量列表。也可以使用自定义距离函数。
- 退货
- Z_orderedndarray
链接矩阵Z的副本，重新排序以最小化相邻树叶之间的距离。
示例
>>> from scipy.cluster import hierarchy >>> rng = np.random.default_rng() >>> X = rng.standard_normal((10, 10)) >>> Z = hierarchy.ward(X) >>> hierarchy.leaves_list(Z) array([0, 3, 1, 9, 2, 5, 7, 4, 6, 8], dtype=int32) >>> hierarchy.leaves_list(hierarchy.optimal_leaf_ordering(Z, X)) array([3, 0, 2, 5, 7, 4, 8, 6, 9, 1], dtype=int32)