skbio.diversity.alpha.pielou_e

skbio.diversity.alpha.pielou_e(counts)[源代码]

计算皮尔洛均匀度指数J’。

状态：从0.4.1开始试验。

Pielou的平整度定义为：

\[J‘=\FRAC{(H)}{\ln(S)}\]

哪里 \(H\) 是计数的Shannon-Wiener熵和 \(S\) 是示例中的OTU数量。

参数:

counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。

返回:

皮埃卢的平整度。

返回类型:

double

参见

shannon, heip_e

备注

这里的实现基于维基百科中的描述 [1]. 它最早是由E.C.Pielou提出的 [2] 与Heip的均衡度相似 [3].

引用