skbio.diversity.alpha.heip_e

skbio.diversity.alpha.heip_e(counts)[源代码]

计算Heip的均匀度。

状态:从0.4.0开始实验。

Heip的平整度定义为:

\[\frc{(e^H-1)}{(S-1)}\]

哪里 \(H\) 是计数的Shannon-Wiener熵(使用对数底 \(e\) )和 \(S\) 是示例中的OTU数量。

参数:

counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。

返回:

海普的均匀度量度。

返回类型:

double

参见

shannon, pielou_e

备注

此处的实现基于 [1].

引用