skbio.sequence.RNA.gc_frequency¶

RNA.gc_frequency(relative=False)[源代码]¶

计算序列中G和C的频率。

状态：0.4.0稳定。

这将计算与IUPAC字符G、C和S（代表G或C）相对应的最小GC频率。

参数:: relative (bool, optional) -- 如果为False，则返回G、C和S字符的频率（即计数）。如果为True，则返回相对频率，即序列中G、C和S字符的比例。在这种情况下，序列也将在操作之前被去除，因此在计算序列长度时不包括间隙字符。
返回:: 频率（计数）或相对频率（比例），取决于 relative .
返回类型:: int or float

参见

gc_content

示例

>>> from skbio import DNA
>>> DNA('ACGT').gc_frequency()
2
>>> DNA('ACGT').gc_frequency(relative=True)
0.5
>>> DNA('ACGT--..').gc_frequency(relative=True)
0.5
>>> DNA('--..').gc_frequency(relative=True)
0

S 方法 G 或 C ，所以它很重要：

>>> DNA('ASST').gc_frequency()
2

其他堕落者不算在内：

>>> DNA('RYKMBDHVN').gc_frequency()
0