skbio.diversity.alpha.simpson_e

skbio.diversity.alpha.simpson_e(counts)[源代码]

计算辛普森均匀度E。

状态:从0.4.0开始实验。

辛普森的E被定义为

\[E=\FRAC{1/D}{S_{OBS}}\]

哪里 \(D\) 是统治地位和 \(S_{obs}\) 是观察到的OTU的数量。

参数:

counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。

返回:

辛普森均匀度E。

返回类型:

double

备注

此处的实现基于中给出的描述 [1].

引用