skbio.diversity.alpha.simpson¶

skbio.diversity.alpha.simpson(counts)[源代码]¶

计算辛普森指数。

状态：从0.4.0开始实验。

辛普森指数定义为 1 - dominance ：

\[1-\sum{p_i^2}\]

哪里 \(p_i\) 是OTU所代表的社区的比例 \(i\) 。

参数:: counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。
返回:: 辛普森指数。
返回类型:: double

参见

备注

这里的实现是 1 - dominance 如中所述 [1]. 其他参考文献(例如 [2]) 将辛普森指数定义为 1 / dominance 。

引用