skbio.alignment.TabularMSA.from_dict

classmethod TabularMSA.from_dict(dictionary)

创建一个 TabularMSA 从A dict .

状态：从0.4.1开始试验。

参数:

dictionary (dict) -- 字典将键映射到 GrammaredSequence 序列对象。这个 TabularMSA 对象的索引标签将设置为字典中的键。

返回:

TabularMSA 从中的键和序列构造的对象 dictionary .

返回类型:

TabularMSA

参见

to_dict, sort

备注

结果中的序列和索引标签的顺序 TabularMSA 对象是任意的。使用 TabularMSA.sort 设置不同的顺序。

示例

>>> from skbio import DNA, TabularMSA
>>> seqs = {'a': DNA('ACGT'), 'b': DNA('A--T')}
>>> msa = TabularMSA.from_dict(seqs)
>>> msa.shape
Shape(sequence=2, position=4)
>>> 'a' in msa
True
>>> 'b' in msa
True