BioSQL.BioSeq模块

在BioSQL之上实现类似Biopython的Seq对象。

这允许使用类似Bioython的SeqRecord和Seq接口检索存储在BioSQL数据库中的项目。

注意：目前我们不支持在BioSQL中记录每个字母的注释(如质量分数)。

class BioSQL.BioSeq.DBSeqRecord(adaptor, primary_id)

基类：SeqRecord

Biopython SeqRecord对象的BioSQL等效项。

__init__(adaptor, primary_id)

创建DBSeqRecord对象。

参数：

• Adaptor-一个BioSQL.BioSeqDatabase.Adaptor对象

• primary_id-BioSQL使用的内部整数ID

您通常不会自己创建DBSeqRecord对象，这是在使用BioSeqDatabase对象时为您完成的

property seq

SEQ对象

property dbxrefs

数据库交叉引用

property features

功能

property annotations

注释