skbio.stats.ordination.pcoa_biplot

skbio.stats.ordination.pcoa_biplot(ordination, y)[源代码]

计算描述符到PCoA矩阵的投影

状态:从0.5.3开始实验。

这种实现方式在勒让德和勒让德的《数值生态学》第三版第9章中有描述。

参数:
  • ordination (OrdinationResults) -- 计算的主坐标分析的维度(n,c),其中矩阵 y 将被投射到。

  • y (DataFrame) -- 按维度表(n,m)的要素采样。这些可以是环境特征,也可以是丰度计数。在维度上不同的物理变量的情况下,该表应标准化。

返回:

修改后的输入对象,包括投影到中的排序空间上的要素 features 属性。

返回类型:

OrdinationResults