skbio.stats.gradient.WindowDifferenceGradientANOVA

class skbio.stats.gradient.WindowDifferenceGradientANOVA(coords, prop_expl, metadata_map, window_size, **kwargs)[源代码]

使用改进的第一差分算法进行轨迹分析

它计算所有时间点的范数,并减去 window_size 和当前元素。

参数:
  • coords (pandas.DataFrame) -- 每个样本ID的坐标

  • prop_expl (array like) -- 每个轴以坐标表示比例的NumPy一维阵列

  • metadata_map (pandas.DataFrame) -- 按样本ID和列索引的元数据地图是元数据类别

  • window_size (int or long) -- 计算差异时要使用的窗口大小

抛出:

ValueError -- 如果Window_Size不是正整数

参见

GradientANOVA

内嵌函数

__eq__(value, /)

返回self==值。

__ge__(value, /)

返回self>=值。

__getstate__ \()

泡菜的帮手。

__gt__(value, /)

返回self>值。

__hash__ \()

返回哈希(self)。

__le__(value, /)

返回self<=value。

__lt__(value, /)

返回self<value。

__ne__(value, /)

回归自我!=值。

__str__ \()

返回str(self)。

方法

get_trajectories \()

计算每个类别中每个组的轨迹并运行