skbio.stats.distance.DistanceMatrix.to_series¶

DistanceMatrix.to_series()[源代码]¶

创建 pandas.Series 从这个开始 DistanceMatrix 。

状态：从0.5.1开始试验。

该系列将以压缩形式包含距离：仅包括距一个矩阵三角形的距离，不包括对角线。该系列的索引将是 pd.MultiIndex 将ID对与距离相关联。ID对将相对于上矩阵三角形以行为主的顺序排列。

要获得所有距离(即上、下矩阵三角形和对角线)，请使用 DistanceMatrix.to_data_frame 。为了获得 only 以缩写形式表示的距离(例如，与本网站一起使用)，使用 DistanceMatrix.condensed_form 。

返回:: pd.Series 索引上有成对的ID。
返回类型:: pd.Series

参见

to_data_frame, condensed_form, scipy.spatial.distance.squareform

示例

>>> from skbio import DistanceMatrix
>>> dm = DistanceMatrix([[0, 1, 2, 3],
...                      [1, 0, 4, 5],
...                      [2, 4, 0, 6],
...                      [3, 5, 6, 0]], ids=['a', 'b', 'c', 'd'])
>>> dm.to_series()
a  b    1.0
   c    2.0
   d    3.0
b  c    4.0
   d    5.0
c  d    6.0
dtype: float64