skbio.stats.distance.DistanceMatrix.read

classmethod DistanceMatrix.read(file, format=None, **kwargs)

创建新的 DistanceMatrix 实例。

这是一种方便的方法 skbio.io.registry.read() . 有关scikit-bio中I/O系统的更多信息，请参阅 skbio.io .

支持的文件格式包括：

• 'binary_dm' (skbio.io.format.binary_dm)

• 'lsmat' (skbio.io.format.lsmat)

参数:

• file (openable (filepath, URL, filehandle, etc.)) -- 读取给定的 format . 被理解的东西 skbio.io.util.open() . Filehandles不会自动关闭，这是调用者的责任。

• format (str, optional) -- 格式必须是具有读取器的格式名称 DistanceMatrix 。如果一个 format 未提供或为NONE，则它将尝试猜测格式。

• kwargs (dict, optional) -- 传递给的关键字参数 skbio.io.registry.read() 和用于的文件格式读取器 DistanceMatrix 。

返回:

一个新实例。

返回类型:

DistanceMatrix

参见

write, skbio.io.registry.read, skbio.io.util.open, skbio.io.format.binary_dm, skbio.io.format.lsmat