skbio.stats.distance.DistanceMatrix.plot

DistanceMatrix.plot(cmap=None, title='')

创建相异矩阵的热图

状态：从0.4.0开始实验。

参数:

• cmap (str or matplotlib.colors.Colormap, optional) -- 设置热图的配色方案，如果 None ，默认为matplotlib RC文件中指定的颜色映射。

• title (str, optional) -- 设置热图的标题标签(默认为空)

返回:

该图包含绘制的相异度矩阵的热图和颜色条。

返回类型:

matplotlib.figure.Figure

示例

使用标记为A-E的五个对象定义相异度矩阵：

>>> from skbio.stats.distance import DissimilarityMatrix
>>> dm = DissimilarityMatrix([[0, 1, 2, 3, 4], [1, 0, 1, 2, 3],
...                           [2, 1, 0, 1, 2], [3, 2, 1, 0, 1],
...                           [4, 3, 2, 1, 0]],
...                          ['A', 'B', 'C', 'D', 'E'])

将相异矩阵绘制为热图：

>>> fig = dm.plot(cmap='Reds', title='Example heatmap')

(Source code, png)