skbio.sequence.Protein.to_regex

Protein.to_regex(within_capture=False)

返回说明退化字符的正则表达式对象。

状态：自0.4.1起稳定。

参数:

within_capture (bool) -- 如果 True ，将序列的regex模式格式化为单个捕获组。如果 False ，按原样编译regex模式，不使用捕获组。

返回:

预编译的正则表达式对象（从 re.compile )它与这个序列的所有确切版本相匹配，没有其他的。

返回类型:

regex

示例

>>> from skbio import DNA
>>> seq = DNA('TRG')
>>> regex = seq.to_regex()
>>> regex.match('TAG').string
'TAG'
>>> regex.match('TGG').string
'TGG'
>>> regex.match('TCG') is None
True
>>> regex = seq.to_regex(within_capture=True)
>>> regex.match('TAG').groups(0)
('TAG',)