skbio.sequence.Protein.__contains__

Protein.__contains__(subsequence)

确定此序列中是否包含子序列。

状态：0.4.0稳定。

参数:

subsequence (str, Sequence, or 1D np.ndarray (np.uint8 or '|S1')) -- 假定的子序列。

返回:

指示是否 subsequence 包含在这个序列中。

返回类型:

bool

抛出:

TypeError -- 如果 subsequence 是一个 Sequence 对象的类型与此序列不同。

示例

>>> from skbio import Sequence
>>> s = Sequence('GGUCGUGAAGGA')
>>> 'GGU' in s
True
>>> 'CCC' in s
False