skbio.sequence.GrammaredSequence.write

GrammaredSequence.write(file, format='fasta', **kwargs)

写一个实例 Sequence 一个文件。

这是一种方便的方法 skbio.io.registry.write() . 有关scikit-bio中I/O系统的更多信息，请参阅 skbio.io .

支持的文件格式包括：

• 'embl' (skbio.io.format.embl)

• 'fasta' (skbio.io.format.fasta)

• 'fastq' (skbio.io.format.fastq)

• 'genbank' (skbio.io.format.genbank)

• 'gff3' (skbio.io.format.gff3)

参数:

• file (openable (filepath, URL, filehandle, etc.)) -- 写入给定的 format 进入。被理解的东西 skbio.io.util.open() . Filehandles不会自动关闭，这是调用者的责任。

• format (str) -- 格式必须是已注册的格式名，其编写器为 Sequence . 默认是 'fasta' .

• kwargs (dict, optional) -- 传递给的关键字参数 skbio.io.registry.write() 以及文件格式编写器。

参见

read, skbio.io.registry.write, skbio.io.util.open, skbio.io.format.embl, skbio.io.format.fasta, skbio.io.format.fastq, skbio.io.format.genbank, skbio.io.format.gff3