skbio.sequence.DNA.read

classmethod DNA.read(file, format=None, **kwargs)

创建新的 DNA 实例。

这是一种方便的方法 skbio.io.registry.read() . 有关scikit-bio中I/O系统的更多信息，请参阅 skbio.io .

支持的文件格式包括：

• 'embl' (skbio.io.format.embl)

• 'fasta' (skbio.io.format.fasta)

• 'fastq' (skbio.io.format.fastq)

• 'qseq' (skbio.io.format.qseq)

• 'genbank' (skbio.io.format.genbank)

• 'gff3' (skbio.io.format.gff3)

参数:

• file (openable (filepath, URL, filehandle, etc.)) -- 读取给定的 format . 被理解的东西 skbio.io.util.open() . Filehandles不会自动关闭，这是调用者的责任。

• format (str, optional) -- 格式必须是具有读取器的格式名 DNA . 如果A format 未提供或未提供，它将尝试猜测格式。

• kwargs (dict, optional) -- 传递给的关键字参数 skbio.io.registry.read() 文件格式读取器 DNA .

返回:

一个新实例。

返回类型:

DNA

参见

write, skbio.io.registry.read, skbio.io.util.open, skbio.io.format.embl, skbio.io.format.fasta, skbio.io.format.fastq, skbio.io.format.qseq, skbio.io.format.genbank, skbio.io.format.gff3