β多样性度量 (skbio.diversity.beta

这个包提供了用于计算样本差异性的beta多样性度量的实现。此软件包的用户还应该探索 scipy.spatial.distance.pdist ,因为它包含其他beta多样性度量的实现,接口与这里提供的类似。

功能

unweighted_unifrac(u_counts, v_counts, ...)

计算未加权UniFrac

weighted_unifrac(u_counts, v_counts, ...[, ...])

使用或不使用分支长度标准化计算加权UniFrac