skbio.diversity.alpha.strong¶
- skbio.diversity.alpha.strong(counts)[源代码]¶
计算斯特朗的优势指数。
状态：从0.4.0开始实验。
斯特朗的优势指数定义为：
\[D_w=最大_i [(\frac{b_i}{N})-\frac{i}{S}]\]哪里 \(b_i\) 是按顺序累计的 \(i^{\text{th}}\) OTU丰度值从大到小排序， \(N\) 是样本中的个体总数，以及 \(S\) 是示例中的OTU数量。括号中的表达式是为所有OTU计算的，并且 \(max_i\) 表示任何OTU的括号中的最大值。
- 参数:
counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。
- 返回:
斯特朗优势度指数(DW)。
- 返回类型:
double
备注
斯特朗的优势度指数定义在 [1]. 此处的实施基于SDR-IV在线手册中的描述 [2].
引用