skbio.diversity.alpha.mcintosh_e¶
- skbio.diversity.alpha.mcintosh_e(counts)[源代码]¶
计算麦金托什均匀度测量E。
状态:从0.4.0开始实验。
麦金托什均匀度E定义为:
\[E = \frac{\sqrt{\sum{n_i^2}}}{\sqrt{((N-S+1)^2 + S -1}}\]哪里 \(n_i\) 中的个数 \(i^{\text{th}}\) 奥图, \(N\) 是个体的总数,以及 \(S\) 是示例中的OTU数量。
- 参数:
counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。
- 返回:
麦金托什均匀度E。
- 返回类型:
double
参见
备注
The implementation here is based on the description given in [1], NOT the one in the SDR-IV online manual, which is wrong.
引用