skbio.diversity.alpha.esty_ci¶
- skbio.diversity.alpha.esty_ci(counts)[源代码]¶
计算Esty的CI。
状态：从0.4.0开始实验。
ESTY的CI定义为
\[F_1/N\PM z\Sqrt{W}\]哪里 \(F_1\) 是单身OTU的数量， \(N\) 是个体总数(所有OTU的丰度之和)，以及 \(z\) 是依赖于目标置信度并基于正态分布的常量。
\(W\) 被定义为
\[FRAC{F_1(N-F_1)+2Nf_2}{N^3}\]哪里 \(F_2\) 是双人OTUS的数量。
- 参数:
counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。
- 返回:
埃斯蒂的可信区间为
(lower_bound, upper_bound)。- 返回类型:
tuple
备注
中定义了ESTY的配置项 [1]. \(z\) 对于95%的置信度区间是硬编码的。
引用