skbio.diversity.alpha.brillouin_d¶
- skbio.diversity.alpha.brillouin_d(counts)[源代码]¶
计算α分集的布里渊指数。
状态:从0.4.0开始实验。
其计算方法如下:
\[HB = \frac{\ln N!-\sum^s_{i=1}{\ln n_i!}}{N}\]哪里 \(N\) 被定义为样本中的个体总数, \(s\) 是OTU的数量,以及 \(n_i\) 被定义为 \(i^{\text{th}}\) 奥图。
- 参数:
counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。
- 返回:
布里渊指数。
- 返回类型:
double
备注
此处的实施基于SDR-IV在线手册中的描述 [1].
引用