skbio.diversity.alpha.berger_parker_d¶
- skbio.diversity.alpha.berger_parker_d(counts)[源代码]¶
计算伯杰-帕克优势。
状态：从0.4.0开始实验。
Berger-Parker优势度定义为样本中属于最丰富的OTU的部分：
\[D=\FRAC{N_{max}}{N}\]哪里 \(N_{max}\) 被定义为最丰富的OTU(或任何最丰富的OTU)中的个体数量，以及 \(N\) 定义为样本中的个体总数。
- 参数:
counts (1-D array_like, int) -- 计数向量。
- 返回:
伯杰-帕克的优势。
- 返回类型:
double
备注
伯杰-帕克支配地位的定义是 [1]. 此处的实施基于SDR-IV在线手册中的描述 [2].
引用