Bio.Phylo.Newick模块

与Newick树相对应的类,也用于Nexus树。

请参阅中的类 Bio.Nexus :Trees.Tree、Trees.NodeData和Nodes.Chain。

class Bio.Phylo.Newick.Tree(root=None, rooted=False, id=None, name=None, weight=1.0)

基类:Tree

Newick树对象。

__init__(root=None, rooted=False, id=None, name=None, weight=1.0)

初始化Newick树对象的参数。

class Bio.Phylo.Newick.Clade(branch_length=None, name=None, clades=None, confidence=None, comment=None)

基类:Clade

Newick Clade(子树)对象。

__init__(branch_length=None, name=None, clades=None, confidence=None, comment=None)

初始化Newick Clade对象的参数。